Kietoutunut ja hienosti tasapainotettu: Endoplasmisen retikulumin morfologia, dynamiikka, toiminta ja sairaudet, osa 7

3.4. ER-dynamiikan laskennallinen analyysi

ER:n dynamiikan analysoiminen in vivo on haastavaa sen monimutkaisen morfologian ja nopean dynamiikan sekä fluoresenssimikroskooppikokeiden fototoksisuuden vuoksi. Verkon matemaattinen mallintaminen tarjoaa mahdollisuuden saada lisää näkemyksiä tästä monimutkaisesta järjestelmästä eri näkökulmasta.

Monimutkaiset muodot tekevät vaikutuksen ja jopa herättävät suurta kiinnostusta. On kuitenkin tutkimisen arvoinen kysymys, ovatko nämä grafiikat, tekstit tai muut muodot helppo muistaa.

Yleisesti ottaen monimutkaiset muodot vaativat enemmän muistia muistaakseen. Esimerkiksi monimutkainen matemaattinen kaava, monimutkainen kuvio tai monimutkainen salasana vaatii meiltä enemmän aikaa ja vaivaa muistaaksemme. Tämä ei kuitenkaan tarkoita, että monimutkaisia ​​muotoja on vaikea muistaa.

Päinvastoin, jos kohtaamme aktiivisesti monimutkaisia ​​muotoja ja omaksumme oikean muistitavan, voimme muistaa ne helposti. Esimerkiksi kun haluamme muistaa monimutkaisen kaavan, voimme käyttää "askel askeleelta muisti" -menetelmää, eli ensin hajottaa kaava pienemmiksi yksiköiksi, muistaa jokainen yksikkö ja lopuksi liittää nämä yksiköt yhteen.

Lisäksi voimme käyttää erilaisia ​​muistitekniikoita auttamaan meitä muistamaan monimutkaisia ​​muotoja. Esimerkiksi assosiaatioiden rakentaminen muodon yhdistämiseksi jo tuttuihin asioihin vahvistaa muistia. Tai voimme muuntaa muodot kuviksi käyttämällä kuvamuistoa, mikä helpottaa muistamista.

Lyhyesti sanottuna monimutkaiset muodot eivät tarkoita, että niitä olisi vaikea muistaa. Niin kauan kuin kohtaamme ne oikealla tavalla ja säilytämme positiivisen asenteen, muistamme ne helposti. Tällaisten ponnistelujen avulla emme voi ainoastaan ​​muistaa paremmin monimutkaisia ​​muotoja, vaan myös parantaa muistiamme ja tulla parempia versioita itsestämme. Voidaan nähdä, että meidän on parannettava muistia, ja Cistanche deserticola voi parantaa muistia merkittävästi, koska Cistanche deserticola on perinteinen kiinalainen lääkeaine, jolla on monia ainutlaatuisia vaikutuksia, joista yksi on parantaa muistia. Cistanche deserticolan teho johtuu sen sisältämistä useista aktiivisista ainesosista, mukaan lukien tanniinihappo, polysakkaridit, flavonoidiglykosidit jne. Nämä ainesosat voivat edistää aivojen terveyttä monin eri tavoin.

Napsauta Tiedä 10 tapaa parantaa muistia

ER-putkia voidaan pitää puolijoustavina polymeereinä, joiden liitokset edustavat ristisidoksia. Viime aikoina monet ryhmät ovat mallintaneet tällaisten puolijoustavien polymeerien silloittuneiden verkkojen dynamiikkaa [263–266], mukaan lukien ne, joihin vaikuttavat aktiiviset voimat, kuten molekyylimoottorit [267–270]. Tällaiset mallit voivat tarjota näkemyksiä ER-verkon dynamiikasta yksinkertaistamalla järjestelmää ja ottamalla huomioon vain vuorovaikutukset mikrotubulusten kanssa.

Äskettäin tehty tutkimus, jossa mallinnetaan puolijoustavien polymeerien verkoston ympäröimän hiukkasen liikettä, voi tarjota näkemyksiä ER:n aktiivisten uudelleenjärjestelyjen toiminnallisesta syystä. Gong et ai. [270] havaitsivat, että puolijoustavien polymeerien verkostoon upotetun hiukkasen diffuusiota tehosti aktiivisten moottoreiden läsnäolo.

Hiukkasten diffuusio verkossa aktiivisten moottoreiden kanssa oli erittäin diffuusiota, kun taas ilman aktiivisia moottoreita havaittiin subdiffuusio. Mahdollinen selitys tälle parantuneelle liikkeelle oli suurempi määrä törmäyksiä hiukkasen ja verkon välillä aktiivisten moottoreiden läsnä ollessa.

Tämä tulos voi liittyä ER:n ontelossa olevien hiukkasten dynamiikkaan. Fluktuaatiot verkon putkissa ja levyissä voivat indusoida hiukkasten nopeampaa dynamiikkaa ontelossa johtuen useammin tapahtuvista törmäyksistä lipidikaksoiskerroksen ontelopinnan kanssa.

On myös osoitettu, että tietyt kasvin ER-morfologian ja -dynamiikan näkökohdat voidaan toistaa pitämällä ER:tä minimaalisena verkkona [271–273], jossa pisteet yhdistetään käyttämällä mahdollisimman vähän putkia. Tämä malli luo tarkasti uudelleen ER-morfologian ja -dynamiikan näkökohdat. Verkon putkimaisten alueiden rakenne luodaan tarkasti uudelleen, samoin kuin renkaan sulkemisen dynamiikka.

Tämä lähestymistapa ei kuitenkaan vielä pysty yhdistämään mallilla havaittua verkon nopeaa uudelleenjärjestelydynamiikkaa kokeellisesti havaittuun [273]. Lumenaalisten hiukkasten liikettä on myös äskettäin simuloitu.

Reaktiopartnereita etsivä malli, joka kuvaa hiukkasten dynamiikkaa ER:n luumenissa, päätteli, että verkoston morfologiset ominaisuudet ovat eniten vaikuttavia tekijöitä, jotka määräävät molekyylien tutkimusaikoja [274].

Tulevat parannukset kuvantamisdataan sekä ER-verkkoa edustaviin malleihin johtavat parannuksiin sekä laskennallisten mallien päätelmissä että kokeellisen datan analysoinnin työnkulkuissa.

Viime aikoina useat ryhmät ovat julkaisseet avoimen lähdekoodin ohjelmistoja, jotka on suunniteltu poimimaan dynaamisia muuttujia elävien solujen ER-videoista [24,27]. Tällaiset menetelmät ER-verkoston morfologian ja dynamiikan kvantifioimiseksi ovat välttämättömiä tämän organellin ymmärtämisen edistämiseksi.

Dynaamisten ja morfologian muutosten analysointi erilaisissa soluolosuhteissavalottaa ER-dynamiikan taustalla olevaa syytä ja kuinka muuttunut dynamiikka voi johtaa kliinisiin patologioihin.

4. Morfologia, dynamiikka ja sairaudet

Ei ole yllättävää, että ER:n kaltainen organelli kriittisten ja monimuotoisten toimintojensa kanssa olisi osallisena monissa sairauksissa. ER:n funktionaalisten alialueiden morfologian ja jakautumisen epäsäännöllisyys (kuten on kuvattu osiossa 2.2) todennäköisesti vaikuttaa niiden toimintaan ja voi johtaa sairaustiloihin, erityisesti hermosoluissa [32].

Monien ER-morfologiaa säätelevien proteiinien tiedetään olevan mutatoituneita ihmisen sairauksissa [227]. ER:n ja mitokondrioiden välinen kommunikaatiovirhe on myös tunnistettu monien sairauksien aiheuttajaksi joko kalsiumionien siirron, insuliinin signaloinnin tai mitokondrioiden jakautumisen vuoksi.

Vuorovaikutukset ER:n ja endosomien/lysosomien välillä ovat yhtä tärkeitä normaalille solutoiminnalle, ja erityisiä ongelmia havaitaan hermosoluissa, kun näihin vuorovaikutuksiin osallistuvat proteiinit mutatoituvat [195, 227].

Lisäksi monet organismit, jotka aiheuttavat patogeenisiä infektioita, luottavat ER-koneistoon replikoituessaan tai soluun pääsyssä. Taulukossa 1 on yhteenveto parhaiten karakterisoidut proteiinit, jotka osallistuvat sekä sairauksiin että ER:n ylläpitoon.

Toinen tärkeä tekijä monissa sairauksissa, erityisesti sydän- ja verisuonitaudeissa, on ER-stressi. MCS:iin vaikuttavat monet muut stressityypit [85 275], joten tämä on todennäköisesti tärkeä tekijä taudissa. Lisätyötä tarvitaan ER-morfologian ja ER-stressin välisen vuorovaikutuksen tutkimiseksi. Liiallisen ER-stressin, UPR-aktivaation ja sairauksien puhkeamisen välisiä yhteyksiä tarkasteltiin äskettäin [276–278], mutta niitä ei käsitellä tässä.

ER-morfologiaa säätelevät proteiinit ovat osallisena monissa sairauksissa, mukaan lukien useat hermostoa rappeuttavat häiriöt (katso [227] erinomainen ja perusteellinen katsaus). Atlastiinien, proteiinien perheen, joka välittää ER-tubulusten fuusioitumista verkkoon [4 348], tiedetään mutatoituneen perinnöllisissä spastisessa paraplegiassa (HSP) [285] ja perinnöllisessä sensorisessa ja autonomisessa neuropatiassa (HSAN) [346 347].

REEP:t ja protrudiini, joiden tiedetään stabiloivan alueita, joissa kalvon kaarevuus on korkea ER:ssä [2 281], mutatoituvat myös joissakin HSP:n muodoissa [280 286], mikä viittaa siihen, että epänormaalilla ER-morfologialla on osansa taudissa. ER-myöhäiset endosomi/lysosomi MCS:t Niitä nähdään usein hermosoluissa [70] ja ne ovat elintärkeitä, koska niihin vaikuttavat yleisesti sairautta aiheuttavat mutaatiot (taulukko 1; [227]). Protrudiinimutaatiot voivat vaikuttaa ER:n jakautumiseen aksoneissa johtuen sen vuorovaikutuksista kinesiinin-1 kanssa ja sen roolista liikkuvien ER-tubulusten myöhäisten endosomien MCS:ien muodostamisessa [205].
Tämä toiminto on elintärkeä tehokkaalle neuriittilaajennukselle [129,195,204,227]. KIF5A:n mutaatiot voisivat vaikuttaa tähän reittiin. ER-endosomaalisten vuorovaikutusten katkeaminen vaikuttaa myös endosomaaliseen lajitteluun ja johtaa lysosomaalisiin vaurioihin (kohdat 2.2.6 ja 3.1.2), ja tämä liittyy usein sairauksiin, kuten HSP ja ALS (taulukko 1), joissa se voi johtua spastiinin mutaatioista. , strumpelin, REEP1 [177] ja VAPB, kuten on kuvattu muualla tässä erikoisnumerossa [291].

ER-morfologiaa ja -dynamiikkaa säätelevien proteiinien mutaatioita on myös liitetty amyotrofiseen lateraaliskleroosiin (ALS), Alzheimerin tautiin, Warburgin mikrosyndroomaan ja tyypin 2 spinocerebellaariseen ataksiaan.

Retikulonit 3 ja 4 mutatoituvat Alzheimerin taudissa [336] ja ALS [299]. Retikulonit säätelevät ER-kalvon kaarevuutta [2] ja niiden mutaatio ALS:ssä muuttaa chaperoniproteiinien jakautumista ER:ssä [299] ja siksi todennäköisesti vaikuttaa negatiivisesti ER:n toimintaan. Äskettäin Mookherjeeet al. havaitsi, että proteiinien aggregaatio sytoplasmassa, joka on hermostoa rappeutuvien sairauksien yleinen tunnusmerkki, vaikuttaa sekä ER-morfologiaan että dynamiikkaan [359].

Reticulon 4:n havaittiin sitoutuvan sytoplasmisiin aggregaatteihin, mikä saattaa olla syynä havaittuun epänormaaliin ER-rakenteeseen. Proteiiniaggregaatteja sisältävissä soluissa havaittiin vähemmän kolmisuuntaisia ​​liitoksia, hitaampaa luumendynamiikkaa ja heikentynyttä tubulusfuusiotehokkuutta.

Siksi morfologiaa säätelevillä proteiineilla ei ole vain roolia taudin puhkeamisessa, vaan ne voivat myös vaikuttaa soluprosesseihin taudin edetessä.

Warburg Micro -oireyhtymä, harvinainen häiriö, joka johtaa hermoston kehityshäiriöihin, voi johtua Rab18:n mutaatioista [29]. Rab18 osallistuu useisiin ER:hen liittyviin prosesseihin, mukaan lukien NRZ-kompleksin ja SNARE-proteiinien ER-lipidipisaroiden MCS:n säätely [343 360] (mutta ei kaikissa olosuhteissa [8]) ja normaalin ER-morfologian ylläpitäminen [8]. Kuten osiossa 3.1.1 on kuvattu, Rab18:n on myös äskettäin osoitettu edistävän anterogradista ER-tiehyekuljetusta vuorovaikutuksensa kinektiinin kanssa-1 [198], ja tämän tuloksen vastaisesti verkoston dynaamiset putkimaiset alueet puuttuivat soluista, joista oli tyhjentynyt Rab18 [8].

Samanlainen suhde morfologiaa säätelevien proteiinien, ER-dynamiikan ja sairauden välillä havaitaan ataksiinilla-2 spinocerebellaarisessa ataksiassa tyyppi 2 (SCA2). Ataksiinin -2 mutaatioiden tiedetään aiheuttavan SCA2:ta [350]. Ataksiinin -2 väheneminen lisäsi arkkien osuutta ER-verkossa sekä haittasi sekä putki- että luumendynamiikkaa [28]. Tubulusten yksisuuntainen pitkän matkan translokaatio väheni, ja FRAP-kokeet osoittivat, että luumenkomponenttien kuljetus oli paljon hitaampaa ilman ataksiinia-2 [28].

Mutaatiot Rab18:ssa ja ataksiinissa-2, proteiineissa, joilla tiedetään olevan rooli ER-tubulusten pidentämisessä, molemmat aiheuttavat puutteita tubulusten morfologiassa ja dynamiikassa. Kalvoa muotoilevien proteiinien ja ER-myöhäisten endosomien/lysosomien MCS-soluihin osallistuvien proteiinien ohella toinen todennäköinen syy sairauksiin on ER:n ja mitokondrioiden välinen kommunikaatiovirhe. ER-mitokondrioiden MCS ovat tärkeitä Ca2+-ionien siirtokohtia [275]. Khachaturian ehdotti ensimmäisen kerran kalsiumin homeostaasin heikkenemistä mahdolliseksi hermostoa rappeuttavien sairauksien syyksi vuonna 1994 [361].

Siitä lähtien monien ER-mitokondrioiden MCS:ää säätelevien proteiinien mutaatiot ovat olleet osallisena ihmisten sairauksiin. Mutaatioita on löydetty kuudesta proteiinista, jotka joko värvätään ER-mitokondrio-MCS:ihin tai osallistuvat niiden muodostumiseen Parkinsonin taudissa: Miro1 [318], Parkin [321], DJ-1 [323], -synukleiini [325], PINK1 [327] ja LRRK2 [329]. Kaikkien näiden mutaatioiden havaittiin muuttavan kalsiumin siirtoa organellien välillä, häiritsevän ER-mitokondrioiden MCS:ää tai molempia (katso taulukko 1). On tärkeää huomata, että Miro1 myös värvää kinesiiniä-1 mitokondrioihin, ja KIF5A-mutaatioiden on osoitettu vaikuttavan mitokondrioiden liikkuvuuteen [362]. Alzheimerin taudissa preseniliinien mutaatiot häiritsevät myös kalsiumionien homeostaasia [335].

Tässä tapauksessa ryanodiinireseptorien (RyR) ja inositoli-1,4,5-trifosfaattireseptorien (IP3R) toiminta on kuitenkin säätelemätöntä MCS:ien sijaan [333,334,363]. Charcot Marie Toothin (CMT) tauti on myös yhdistetty mutaatioihin ER-mitokondrioissa MCS:ää muodostavissa proteiineissa [303,306], vaikkakaan yhteyttä CMT:n ja kalsiumdynamiikan välillä ei ole löydetty.

ER:n ja mitokondrioiden välisten kalvon kosketuskohtien säätelyhäiriöt on myös liitetty muihin ei-neurodegeneratiivisiin sairauksiin. Heikentynyt insuliinisignalointi, diabeteksen tunnusmerkki, havaitaan soluissa, joissa on mutaatioita mitofusiini 2:ssa [308 309] ja VDAC-1/grp75/IP3R-1 Ca2+ -siirtokompleksissa [310], molemmissa joista ER- ja mitokondriot kytkeytyvät MCS:iin.

Lisäksi monet ER-mitokondrioiden rajapinnassa olevat proteiinit on liitetty erilaisiin syöpiin (tarkisteltu julkaisussa [345]). Dynamiiniin liittyvän proteiinin 1 mutaatioista johtuvat epänormaalit mitokondrioiden fissionaattiset ER–ER-mitokondrio-MCS:t johtavat myös enkefalopatiaan [340]. Lisäksi ER-mitokondrioiden MCS:t on liitetty ALS-viamutaatioihin sigma{6}}-reseptorissa [300], joka on osallisena Ca2+-homeostaasissa MCS:issä. Nämä MCS:t hajosivat mutanttisoluissa [302]. ALS-mutaatiot on myös yhdistetty muuttuneeseen Ca2+-dynamiikkaan ER-mitokondrioiden MCS:issä. VAPB:n ALS-mutanttimuoto johtaa muuttuneeseen MCS:ään ulomman mitokondrion kalvoproteiinin PTPIP51 kanssa, mikä häiritsee Ca2+-ottoa näissä MCS:issä [296].

Monet muut ALS-mutaatiot vaikuttavat ER:n ja mitokondrioiden välisiin kontakteihin, kuten VAPB:ssä oleviin (katso Chen et al. ja Borgese et al. arviot tässä numerossa [275 291]). Solunsisäiseen kalsiumin homeostaasiin liittyy myös MCS:itä ER:n ja plasmamembraanin välillä. Kun ER-kalsiumvarastot loppuvat, solunulkoinen Ca2+ siirtyy plasmakalvon läpi ER:hen MCS:ssä SOCE:n kautta.

ER:ssä asuva proteiini STIM1 ja plasmamembraanissa oleva proteiini Orai1 muodostavat kompleksin, joka helpottaa SOCE:tä (katso kohta 2.2.4). Mutaatioiden toisessa tai molemmissa näistä proteiineista tiedetään aiheuttavan tubulaarista aggregaattimyopatiaa (TAM) ja siihen liittyvää tilaa Stormorkenin oireyhtymä kalsiumin homeostaasin säätelyhäiriön kautta [311–315]. Koska STIM1:n sitoutuminen EB-proteiineihin tuottaa TAC:ita, on mielenkiintoista määrittää näiden mutaatioiden vaikutukset TAC-pohjaiseen ER-tubulusten laajenemiseen. Patogeeniset infektiot ovat myös yhteydessä ER:hen liittyviin proteiineihin.

Patogeenit kaappaavat ER:n isäntäsolussa edistääkseen niiden replikaatiota (tarkasteltu julkaisussa [364 365]). Useille näistä patogeeneista on löydetty proteiineja, jotka sitoutuvat ER:ssä oleviin proteiineihin muodostaen MCS:itä. Nämä kohdat ovat tärkeitä patogeenin replikaatiolle.

Tunnettuja ER:n kanssa vuorovaikuttavia patogeenejä ovat Legionella pneumophila [352], Brome mosaic virus (BMV) [356], vaipaton polyomavirus SV40 [206], enterovirus 71 [357], flavivirukset, kuten Zika-virus [358] ja Chlamydia trachomatis. Legionella pneumophila kohdistuu retikuloniin sitoutumalla Ceg9:ään [352], BMV:ään virusproteiinin 1a:n kautta [356] ja enterovirus 71:een enterovirusproteiinin 2C:n kautta [357].

Patogeenin replikaatiota edistää retikulonien sitoutuminen kaikissa näissä kolmessa tapauksessa [351 356 357]. Legionella pneumophila on myös vuorovaikutuksessa atlastiinien [352] kanssa edistääkseen replikaatiota [351], samoin kuin flavivirusperheen jäsenet: Dengue-virus, Zika-virus ja Länsi-Niilin virus [358]. Chlamydia trachomatis -proteiinit sitoutuvat VAPA:han, VAPB:hen [353] ja CERT:iin [354] muodostaen kalvokontaktikohtia ER:n kanssa.

CERT:n tai VAP-proteiinien ehtyminen vähensi bakteerien replikaatiota [354], mikä osoittaa jälleen kerran, että ER-patogeenien MCS:t ovat kriittisiä patogeenien replikaatiolle. Mielenkiintoista on, että ER-kalvoa muotoilevien proteiinien on myös havaittu estävän viruksen replikaatiota. Retikulonin 3 havaittiin sitoutuvan hepatiitti C -viruksen ei-rakenteelliseen proteiiniin 4B (NS4B) [366]. NS4B:n itseoligomeroituminen helpottaa viruksen replikaatiota [367].

Kuitenkin, kun retikuloni 3 on sitoutunut, NS4B:n itseoligomeroituminen estyy ja siksi viruksen replikaatio suppressoituu [366]. SV40 pääsee sytoplasmaan tunkeutumalla ER-kalvon läpi ERAD-koneiston avulla [368], todennäköisimmin laajentuneessa perinukleaarisessa ERQC:ssä (kohta 2.2.1), ja tähän on ehdotettu liittyvän kinesiini-1-toimintoa B14:ään sitoutumisen kautta. ER-lokalisoitu DNA-J-domeenia sisältävä kalvoproteiini [206].

Yhteenvetona voidaan todeta, että yksittäisten proteiinien mutaatioilla voi olla katastrofaalisia vaikutuksia ER-morfologiaan, dynamiikkaan ja MCS:iin, mikä johtaa kliinisiin patologioihin. Monissa tapauksissa morfologia, dynamiikka ja MCS:t liittyvät tiiviisti toisiinsa, ja mutaatiot, jotka vaikuttavat yhteen näistä kolmesta ominaisuudesta, aiheuttavat usein knock-on-vaikutuksia muille. Viimeaikainen sairauksia aiheuttavien mutaatioiden tutkimus on alkanut pitää ER-morfologiaa ja -dynamiikkaa toisiinsa liittyvinä aiheina sen sijaan, että niitä tarkastellaan itsenäisesti.

Tuleva työ tällä alalla tarjoaa todennäköisesti käsityksen morfologian ja dynamiikan välisestä suhteesta sekä siitä, kuinka ER-dynamiikka liittyy sairauksiin, joiden tiedetään muuttavan morfologiaa.

5. Keskustelu

Monia proteiineja, jotka vastaavat ER-morfologian säätelystä, on tunnistettu, ja morfologian ja toiminnan väliset yhteydet ovat nyt käymässä selväksi. Olemme vasta alkamassa kvantifioida ER-dynamiikkaa ja ymmärtää, mikä vaikutus dynamiikalla voi olla organellin suorittamiin prosesseihin.

Morfologiaa säätelevien proteiinien mutaatioiden on havaittu aiheuttavan monia ihmisen sairauksia (taulukko 1), ja monissa tapauksissa ER:n rakenne oli epänormaali, mikä osoittaa, että ER:n morfologia, dynamiikka ja toiminta liittyvät oleellisesti toisiinsa. Päivystysdynamiikka on myös selvästi elintärkeä päivystyskeskuksen ja sen monien MCS-järjestelmien luomisessa ja ylläpitämisessä. Jälleen mukana olevat proteiinit mutatoituvat tavallisesti taudissa. Tulevaisuuden keskeinen haaste on määritellä tämän dynamiikan roolit ja erottaa erilaisten motiliteettien panos.

Tämä vaatii nopeamman kuvataajuuden, jota on yleisesti käytetty, koska erittäin liikkuvat ER-tubulukset ja mahdollisesti vuorovaikutuksessa olevat organellit liikkuvat jopa 5 µm/s nopeuksilla, eikä niitä voida havaita luotettavasti kuvattaessa yhdellä ruudulla 1,5–5 sekunnin välein, kuten yleensä on tehty. käytetty (esim. [22,38,75,176,219]). On myös tärkeää huomata, että ER-dynamiikkaa tutkivalla solulinjalla, Cos{10}}-solulla, on paljon vähemmän dynaaminen ER kuin muilla solulinjoilla [20].

Kiinteiden ja elävien solujen superresoluutiomikroskoopin tulo tarjoaa jatkossakin runsaasti uutta ymmärrystä ER-rakenteesta ja dynamiikasta. Odotamme, että äskettäin julkaistujen useiden ER-dynamiikan analysointi- ja kvantifiointimenetelmien myötä löydetään lisää yhteyksiä säätelemättömän ER-dynamiikan ja sairauden välillä. Toivottavasti nämä löydöt johtavat lisäymmärrykseen ER-liikkeen toiminnallisesta perustasta. ER-dynamiikan tutkimuksen tulevaisuus näyttää valoisalta!
Tekijän panokset: HTP ja VA kirjoittivat käsikirjoituksen. Kaikki kirjoittajat ovat lukeneet käsikirjoituksen julkaistun version ja hyväksyneet sen.

Rahoitus: HTP:tä rahoitti Engineering and Physics Research Council Ph.D. DTP-opiskelu, apurahanumero EP/N509565/1.

Institutionaalisen arviointilautakunnan lausunto: Ei sovelleta.

Ilmoitettu suostumus: Ei sovelleta.

Tietojen saatavuusilmoitus: Ei sovelleta.

Kiitokset: Tämä arvostelu on käsitellyt erittäin monimutkaista aihetta, ja haluamme pahoitella kollegoiltamme, joiden työtä emme voineet käsitellä.
Eturistiriidat: Kirjoittajat eivät julista eturistiriitoja. Rahoittajalla ei ollut roolia käsikirjoituksen kirjoittamisessa tai tulosten julkaisupäätöksessä.

Viitteet

1. Valm, AM; Cohen, S.; Legant, WR; Melunis, J.; Hershberg, U.; Odota, E.; Cohen, AR; Davidson, MW; Betzig, E.; Lippincott-Schwartz, J. Järjestelmätason spektrikuvauksen ja -analyysin soveltaminen organellien vuorovaikutuksen paljastamiseen. Nature 2017, 546, 162–167.[CrossRef] [PubMed]

2. Voeltz, GK; Prinz, WA; Shibata, Y.; Rist, JM; Rapoport, TA Luokka kalvoproteiineja, jotka muodostavat tubulaarisen endoplasmikretikuumin. Cell 2006, 124, 573–586. [CrossRef]

3. Hu, J.; Shibata, Y.; Voss, C.; Shemesh, T.; Li, Z.; Coughlin, M.; Kozlov, MM; Rapoport, TA; Prinz, WA Endoplasmisen retikulumin kalvoproteiinit indusoivat korkeakaarevia tubuluksia. Tiede 2008, 319, 1247–1250. [CrossRef] [PubMed]

4. Hu, J.; Shibata, Y.; Zhu, PP; Voss, C.; Rismanchi, N.; Prinz, WA; Rapoport, TA; Blackstone, C. Dynamiinin kaltaisten GTPaasien luokka, jotka osallistuvat putkimaisen ER-verkon luomiseen. Cell 2009, 138, 549–561. [CrossRef]

5. Orso, G.; Pendin, D.; Liu, S.; Tosetto, J.; Moss, TJ; Faust, JE; Micaroni, M.; Egorova, A.; Martinuzzi, A.; McNew, JA; et al. ER-kalvojen homotyyppinen fuusio vaatii dynamiinin kaltaista GTPaasi Atlastinia. Nature 2009, 460, 978–983. [CrossRef] 

6. Wang, S.; Tukachinsky, H.; Romano, FB; Rapoport, TA ER:tä muotoilevien proteiinien atlastiinin, lunaparkin ja retikulonin yhteistyö tuottaa putkimaisen kalvoverkoston. Elife 2016, 5, 1–29. [CrossRef]

7. englanti, AR; Voeltz, GK Rab10 GTPaasi säätelee ER-dynamiikkaa ja morfologiaa. Nat. Cell Biol. 2013, 15, 169–178.[CrossRef] [PubMed]

8. Gerondopoulos, A.; Bastos, RN; Yoshimura, SI; Anderson, R.; Carpanini, S.; Aligianis, I.; Handley, MT; Barr-, FA Rab18- ja aRab18 GEF -kompleksi tarvitaan normaaliin ER-rakenteeseen. J. Cell Biol. 2014, 205, 707–720. [CrossRef]

9. Chen, S.; Novick, P.; Ferro-Novick, S. ER-verkon muodostuminen vaatii tasapainoa dynamiinin kaltaisen GTPase Sey1p:n ja Lunaparkin perheenjäsenen Lnp1p:n välillä. Nat. Cell Biol. 2012, 14, 707–716. [CrossRef]

For more information:1950477648nn@gmail.com