Herba Cistanchesista peräisin olevien fenyylietanoidiglykosidien potentiaali Oecuar Lyeeanisnia vastaan

Hepatosellulaarinen karsinooma: perustuu verkkofarmakologiaan ja molekulaariseen telakointiinZHANG Jiawei', WEN Limei? , HU Junping', YANG Jianhua? (1 College of Pharmaceutical Sciences, Xinjang Medical University, Urumqi 830054, Kiina; 2 Department of Pharmacy, First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University, Urumqi 830011, China)

Abstrakti

Tavoite: Tutkia potentiaaliafenyylietanoidiglykosidien molekyylimekanismialkaenHerha Cistanches (CPhG)hepatosellulaarista karsinoomaa (HCC) vastaan ​​verkkofarmakologian ja molekyylitelakoinnin avulla. Menetelmät: CPhG:n aktiiviset ainesosat ja mahdolliset kohteet haettiin "The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platformista ('TCMSP) ja muista tietokannoista ja kirjallisuudesta sekä HCC:hen liittyvät kohteet "Therapeutic Target Database ('TT), Genecardsand" -sivustolta. muut tietokannat. Siten CPhG:n ja taudin yhteiset kohteet saatiin ja proteiini-proteiini-vuorovaikutusverkko (PPl) rakennettiin tärkeimpien kohteiden seulomiseksi. Tärkeimmät kohteet tuotiin DAVlD:hen geenien ontologian (GO) rikastamiseen ja Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) -polun rikastamiseen. Lopuksi AutoDock vinaa käytettiin tärkeimpien aktiivisten aineosien ja ydinkohteiden molekyylitelakointiin. Tulokset: Yhteensä 29 aktiivista ainesosaa CPhG:stä seulottiin, mukaan lukien 410 kohdegeeniä. HCC:n hoitoon suoraan liittyvät signalointireitit olivatsyövän signalointireitti, syövän proteoglykaani. reitti, fosfatidyyli-inositoli-3-kinaasi-proteiinikinaasi B (Pl3K-Akt) -signalointireitti, verisuonten endoteelin kasvutekijän (VEGF) signaalireitti jne. "Molekylaarisen telakoinnin tulokset osoittavat, että seulotuilla kohdereseptoriproteiineilla oli korkea sitoutumisaffiniteetti aktiiviset aineet. Johtopäätös: CPhG:t voivat säädellä syöpäsoluja, angiogeneesiä ja muita useiden komponenttien, useiden kohteiden ja useiden reittien kautta, jolloin niillä on terapeuttisia vaikutuksia HCC:hen.

Avainsanat ; hepatosellulaarinen karsinooma; Verkko-farmakologia; Molecular doc.king,Cistanche

CISTANSSIUUTEMAKSAN SUOJAUS

Ensisijainen maksasyöpär on yksi pahanlaatuisista kasvaimista, jolla on korkea sairastuvuus ja kuolleisuus maailmassa, ja eloonjäämisaste viiden vuoden sisällä on vain 7 % [1]. Hepatosellulaarinen karsinooma (HCC) on tärkein patologinen tyyppi, ja sen osuus on yli 85 % [2]. Uusimmat tiedot osoittavat, että HCC:n kuolleisuus ja ilmaantuvuus maassani ovat kolmannella ja neljännellä sijalla kaikkien pahanlaatuisten kasvainten joukossa, ja sille on ominaista nopea kehitys ja helppo uusiutuminen [3-4]. Maksasyövän etiologia ja patogeneesi ovat edelleen epäselviä. Sen esiintyminen voi liittyä isäntägeenin polymorfismiin, ympäristötekijöihin (mukaan lukien metabolinen oireyhtymä ja aflatoksiini B1), alkoholinkäyttöön ja virustekijöihin (mukaan lukien hepatiitti B- ja C-hepatiittivirusinfektio). ) liittyvät vuorovaikutukseen [5]. Perinteistä kiinalaista lääketiedettä voidaan käyttää potilailla, joilla on pitkälle edennyt HCC, ja sillä on kasvaimia estäviä vaikutuksia, jotka vähentävät sädehoidon ja kemoterapian haittavaikutuksia, parantavat kasvainpotilaiden immuniteettia ja parantavat elämänlaatua [6]. Cistanche deserticola on Orobanchiaceae-kasvin laji Cistanche cistanche Cistanche deserticolaY. C. Ma tai Cistanche tuberosum Cistanche Cistanche. CHE TUBULOSA (SCHENK)

Kuivatut, mehevät varret ja hilseilevät Wightin [7] lehdet ovat tehtäviäravitsee munuaisia, täydentävä olemus, ja kosteuttava

Sillä on kuivattava ja laksatiivinen vaikutus. Se on harvinainen ja arvokas vahvistava lääkeaine, joka on ainutlaatuinen kotimaani luoteisosan kuivilla alueilla, ja sillä on pitkä käyttöhistoria. Cistanche deserticola nauhoitettiin ensimmäisen kerran Itä-Han-dynastian "Shen Nong's Materia Medicassa": "Se maistuu makealta ja hieman lämpimältä. Se hoitaa viittä synnytystyyppiä ja seitsemää vammaa. Se ravitsee keskiosaa, poistaa kylmyyttä, lämpöä ja kipua varresta , ravitsee viittä sisäelintä, vahvistaa yiniä, täydentää esanssia ja qi:tä sekä auttaa synnytyksessä ja naisten oireyhtymässä "Pitkäaikainen käyttö keventää kehoa" ja on luokiteltu huippuluokkaan [8]. Feny⁃

Cistanchen letanoidiglykosidit, CPhG:t) sistansseina Sen tärkeimpiä vaikuttavia aineita ovat verbaskosidi, echinaceaside, salidrosid, 2'-asetyyliverbaskosidi, tubuliini B jne. [9], sillä on maksan suojaamisen, dementian, väsymyksen, iskemiasuojan, osteoporoosin, laksatiivisen, immuunijärjestelmän säätelyn, ikääntymisen eston ja lisääntymistä parantavan toiminnon [10].

Tutkimukset ovat osoittaneet, että CPhG:llä on hyvä vaikutus maksasyövän ehkäisyssä ja hoidossa. Yuan et ai. [11] osoitti, että CPhG:t estävät H22-solujen kasvua eksogeenisten ja endogeenisten apoptoosireittien kautta. Hu Qiong et ai. [12] havaitsivat, että CPhG:t voivat estää maksasyövän solujen kasvua, mikä saattaa liittyä CPhG:ihin, jotka vähentävät AFP:n pitoisuutta kasvaimia kantavien hiirten seerumissa ja parantavat kasvainta kantavien hiirten immuniteettia. Tällä hetkellä ei ole olemassa syvällistä tutkimusta CPhG:iden roolista HCC:n ehkäisyssä ja hoidossa ja sen molekyylien vaikutusmekanismissa, eikä sen aktiivisia aineosia, toimintakohteita ja molekyylimekanismeja ole vielä täysin selvitetty.

Verkkofarmakologia päivittää olemassa olevan "yksi kohde, yksi lääke" -lähestymistavan "verkostokohde-monikomponentti" -tutkimuslähestymistapaksi, eli tältä pohjalta se tekee kattavan analyysin perinteisen kiinalaisen lääketieteen tehokkuudesta ja tutkii perinteistä kiinalaista lääketiedettä. systeemisestä näkökulmasta ja molekyylitasolla. , rakentaa uusia ideoita perinteisen kiinalaisen lääketieteen verkkofarmakologiaan [13-14]. Tämä tutkimus käyttää verkostofarmakologisia strategioita ja perustuu perinteisen kiinalaisen lääketieteen kokonaisvaltaiseen näkemykseen. Tutkimuksessa tutkitaan systemaattisesti CPhG:iden vaikutusmekanismia HCC:n ehkäisyssä ja hoidossa. Yhdistettynä monitasoiseen verkkomalliin "TCM⁃aktiiviset ainesosat -kohdesignaalireitit", CPhG:n tehokkuus HCC:n ehkäisyssä ja hoidossa ennustetaan. Tärkeimmät kohteet ja vaikutusmekanismit varmistettiin käyttämällä molekyylitelakointitekniikkaa ja kehitettiin CPhG:n monikomponenttien, -kohteiden ja -reittien synergistinen mekanismi, mikä paransi merkittävästi CPhG:n lääkeresurssien kehittämistä ja tarjosi viittaus myöhempään tutkimukseen.

1 Materiaalit ja menetelmät

1.1 CPhG-komponenttien kokoelma

Hakemalla perinteisen kiinalaisen lääketieteen järjestelmän farmakologian tietokannasta ja analyysialusta (Traditional Chinese System Pharmacology farmakologian tietokanta ja analyysialusta, TCM SP), Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine Database (Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine) jumalallinen, ETCM), Traditional Chinese Medicine Comprehensive Database (Perinteinen kiinalainen lääketiede I tornado

pohja, TCCMID) ja muut tietokannat ja yhdistetty kansallisiin tietoinfrastruktuuritietoihin

Tietokanta (China National Knowledge Infrastructure, C CPhG:iden kemiallisen koostumuksen ja kohdetietojen keräämiseen käytettiin NKI- ja PubMed-tietokantojen relevanttia kirjallisuutta. TCMSP-, ETCM-, TCMID-tietokannoista ja kirjallisuudesta etsimällä löydettiin lopulta 29 yhdistettä.

Ehdokasyhdisteinä [15-16].

1.2 Lääkkeiden mahdollisten terapeuttisten kohteiden ennustaminen ja "TCM-Active Ingredient-Target" -verkkokaavion rakentaminen

Haettujen komponenttien SDF-muotoiset tiedostot tuotiin PharmMapper-tietokantaan mahdollisten kohteiden ennakoivaa analyysiä varten, ja UniProt KB -hakutoimintoa käytettiin kohteen nimien korjaamiseen. Cytoscape 3. 8. 0 -ohjelmistoa käytettiin "TCM-Active Ingredient-Target" -verkkokaavion rakentamiseen.

1.3 HCC:hen liittyvien geenien seulonta

Käytä "hepatosellulaarista karsinoomaa" ja "HCC" avainsanoina hakeaksesi seuraavista 4 tietokannasta saadaksesi HCC-kohdetiedot: 1) O MIM-tietokanta; 2) DrugBank-tietokanta; 3) GeneCards-tietokanta; 4) Terapeuttinen kohdetietokanta (Therapeutic Target Database, TTD, http://db.i drlab.net/ttd). Seulonnan jälkeen kohdetiedot kootaan ja järjestetään.

1. 4 CPhG:iden kohdekartoitus HCC:n hoitoon

Waynetun tekemiseksi online-piirustusohjelmiston kautta CPHGS-komponentin kohde kartoitetaan HCC-kohteen kanssa. Risteyskohde on CPHGS-komponentin HCC-luokan mahdollinen kohde. Taudin risteyskohteet.

1. 5. Proteiinin ５ proteiinivuorovaikutuksen rakentaminen

(PROTEIN⁃PROTEIN Intere⁃ACTION, PPI) the network uses the STRING database: / / / / sTRING⁃DB. ORG /) for PPI analysis of the target. Set the COMBI NED SCORE>{{0}}. 4 ja käytä Cytoscape 3. 8. 0 -ohjelmaa tulosten topologisen analyysin suorittamiseen ja seuloa tärkeimmät jaetut kohteet, joiden astearvo on suurempi kuin 2 kertaa mediaani.

1.6 Gene Ontology (GO) -rikastusanalyysi ja Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (Kyoto Encyclopedia) ia geenien ja genomien tietosanakirja, KEGG) rikastusanalyysi

DAVID-tietokantaa käytettiin GO-analyysin ja KEGG-reitin rikastusanalyysin suorittamiseen kohdeproteiineille, joiden kanssa CPhG:t ja HCC olivat yhdessä vuorovaikutuksessa, ja kynnys P Pienempi tai yhtä suuri kuin {{0}}.05 asetettiin seulomaan. Selvitä biologiset prosessit ja reitit, joissa on merkittäviä eroja, ja käytä Cy⁃to ｓｃａｐｅ 3. 8.0 Ohjelmisto rakentaa "TCM⁃Active Ingredients⁃Targets Pathway" -verkoston.

1.7 Ydinkohteiden molekyylitelakkavarmennus Valitse tärkeimmät kohdeproteiinit

Valkoista käytettiin molekyylitelakointiin. Näiden kohdeproteiinien kiderakennetiedostot saatiin RCSBPDB-tietokannasta. Näiden kohteiden vaikuttavien aineiden rakennetiedostot saatiin PubChem-tietokannasta. Autododock{0}}vina-ohjelmistoa käytettiin laskemaan kohdeproteiinien ja aktiivisten aineosien välisen alhaisimman sitoutumisenergian välinen suhde, ja se visualisoi molekyylitelakoinnin simulaation todentamisen tulokset.