OSA 2 Laadun vaihtelun ja Cistanche Deserticolan ympäristön välinen suhde kolmessa ekotyypissä maaperän mikrobiomianalyysiin perustuen
Mar 03, 2022
Lisätietoja saat ottamalla yhteyttä:Joanna.jia@wecistanche.com
korrelaatiot keskeisten mikrobiyhteisöjen runsauden, PhGs-pitoisuuden ja ekologisten tekijöiden välillä.Ydin-, biomarkkerimikrobiomien runsauden, PhGs-pitoisuuden ja ekologisten tekijöiden redundanttianalyysi suoritettiin tilaustasolla ja uudelleenanalyysi tehtiin vaikutusten perusteella. Varianssin oikaistu tulkinta oli 82,70 prosenttia (taulukko S7). Sphingomonadales selitti 45,7 prosenttia PhGs-pitoisuudesta (p=0.002). Pseudonocardiales selitti 22,4 prosenttia PhGs-pitoisuudesta (p=0.01). 2'-asetyylilakteosidi korreloi merkitsevästi positiivisesti Pseudonocardiales- ja Oceanospirillales- ja negatiivisesti Sphingomonadalesin kanssa (kuva 5a). Ekinakosidi oli merkitsevästi positiivinen Sphingomonadalesilla.
Cistancheuute voi estääAlzheimerin tautisairaus
Korrelaatioanalyysi suoritettiin biomarkkerien runsaudelle,PhGsisältö (kuva S3 ja taulukko S5) ja ekologiset tekijät (taulukko S6). Korrelaatioverkostojen tulokset (kuva 5b) paljastivat, että 2'-asetyylilakteosidi korreloi merkitsevästi positiivisesti Oceanospirillales-, Rhizobiales- ja Thiotrichales-bakteerien kanssa, kun taas negatiivisesti korreloi Pseudonocardiales- ja Nitrosomonadales-bakteerien kanssa kaikissa maanäytteissä. Lämpökartta (kuvat 5c–e) paljasti, että taulukon sivu A korreloi negatiivisesti keskimääräisen vuotuisen vesihöyrynpaineen kanssa suolaliuos-alkalissakorrelaatiot keskeisten mikrobiyhteisöjen runsauden, PhGs-pitoisuuden ja ekologisten tekijöiden välillä.Ylimääräinen analyysi ydin-, biomarkkeri-mikrobiomien runsaudesta,PhGssisältö ja ekologiset tekijät tehtiin tilaustasolla ja uudelleenanalyysi tehtiin vaikutusten perusteella. Varianssin oikaistu tulkinta oli 82,70 prosenttia (taulukko S7). Sphingomonadales selitti 45,7 prosenttia PhGs-pitoisuudesta (p=0.002). Pseudonocardiales selitti 22,4 prosenttia PhGs-pitoisuudesta (p=0.01). 2'-asetyylilakteosidi korreloi merkitsevästi positiivisesti Pseudonocardiales- ja Oceanospirillales- ja negatiivisesti Sphingomonadalesin kanssa (kuva 5a). Ekinakosidi oli merkitsevästi positiivinen Sphingomonadalesilla.
Korrelaatioanalyysi suoritettiin biomarkkeri Abun I -maalle. Samaan aikaan cistanosidi A korreloi merkittävästi positiivisesti Micrococcalien kanssa ja negatiivisesti Rhizobialesin kanssa suola-alkalimaissa (kuvio 5c). Niityillä 2'-asetyylilakteosidi korreloi negatiivisesti vuotuisen keskilämpötilan kanssa (kuva 5d). Hiekkaisessa maassa tubulosidi A korreloi negatiivisesti Nitrosomonadalesin kanssa (kuva 5e).
bakteerimikrobiomin ennustava toiminta C. deserticolan kolmessa ekotyypissä.Bakteerimikrobiomin toiminnalliset profiilit ennustettiin purettujen bakteeritaksonien 16S-rRNA-geenin kopiomäärän perusteella käyttäen Tax4Fun-ohjelmaa KEGG Ortholog -ryhmien (KOs) mukaisesti. Toiminnallisen ennusteen tulokset (kuva 6) osoittivat, että maaperän mikrobiomien toiminnalliset aineenvaihduntat C. deserticolan kolmessa ekotyypissä olivat identtisiä. Aineenvaihdunnoissa oli runsaasti hiilihydraatti-, aminohappo-, yhteistekijöitä sekä vitamiini- ja energia-aineenvaihduntaa. Myös kalvon siirto ja signaalinsiirto olivat runsaasti ympäristötiedon käsittelyssä.
Cistancheote ontulehdusta ehkäiseväominaisuuksia
Keskustelu
Aikaisempi työmme osoitti, että psbA-käännössekvenssiä ja 2'-asetyylilakteosidia voidaan käyttää molekyyli- ja kemiallisina markkereina erottamaanC. deserticaXinjiangista ja Sisä-Mongoliasta27. Kenttätutkimuksissa havaitsimme, että C. desertica asuu pääasiassa kolmentyyppisissä elinympäristöissä, mukaan lukien suola-alkalimaa EbinurLaken varrella, hiekkamaa Alexa Leaguen ympärillä ja väliaavikon niityt. Kolmen ekotyypin C. desertica aineenvaihduntaprofiilit osoittivat myös, että 2'-asetyylilakteosidia voidaan käyttää kemiallisena merkkiaineena erottamaan kolme ekotyyppiä1. Käsittelimme C. deserticolan laadun vaihtelua ja sen muodostumismekanismia perinnöllisyyden, aineenvaihdunnan ja ilmastotekijöiden ulottuvuuksista. Siksi mikronäkökulmasta korrelaatioverkko-analyysi
mikrobiomien runsaus,PhGssisällöstä ja ekologisista tekijöistä selvitettiin maaperän kolmen ekotyypin mikrobiyhteisön piirteitä.C. deserticolaja niiden suhde laadun vaihteluun.
vettä. Lisäksi Bacillalescan tuottaa runsaasti aineenvaihduntatuotteita, jotka syntetisoivat erilaisia orgaanisia happoja, entsyymejä, fysiologisia aktiviteetteja ja muita aineita sekä monia muita helposti hyödynnettäviä ravintoaineita33. Kolmen ekotyypin yhteiset ympäristöominaisuudet C. deserticolaovat kuivuus ja maaperän aavikoituminen. Ebinur-järven ympärillä olevaan maaperään liittyy myös suola-alkalistressiä. Tämä saattaa olla syynä siihen, että kolmen ekotyypin maaperän ydinmikrobiyhteisöillä on tiettyjä kuivuuden, suolan sietokyvyn, alkalinkestävyyden ja stressin kestävyyden ominaisuuksia.
Cistancheuute voi vastustaasäteilyä
Mikrobitekijät, jotka vaikuttavat PhG:iden vaihteluun kolmessa C. deserticolan ekotyypissä.Kuva S3 esittää laatikkokaavion C. deserticolan kolmen ekotyypin PhG-pitoisuudesta. Kuvasta käy ilmi, että 2'-asetyylilakteosidipitoisuus on korkeampi suola-alkalimaalla kuin niityllä ja hiekkamaalla, mikä on yhdenmukainen aikaisempien tulosten kanssa1. Redundantti analyysi ja assosiaatioverkoston tulokset osoittavat, että Oceanospirillales korreloi merkittävästi positiivisesti 2'-asetyylilakteosidin kanssa. Oceanospirillales, korkein biomarkkeri LDA-pisteiden suhteen suola-alkalimaalla, on erityisesti rikastettu. Nämä bakteerit ovat metabolisesti ja morfologisesti monimuotoisia, ja osa niistä voi kasvaa hapen läsnä ollessa, kun taas toiset tarvitsevat anaerobista ympäristöä34. Oceanospirillales ovat proteobakteerien ryhmä, joka koostuu kahdesta perheestä. Merispirillum on usein luita syövien matojen (Osedax) endosymbiontti35. Useimmat Oceanospirillales suosivat tai vaativat suuria suolapitoisuuksia kasvaakseen. Huolimatta kasvustaan erilaisissa markkinarakoissa, Oceanospirillales saavat energiaa erilaisten luomutuotteiden hajoamisesta. Siksi korkea suolapitoisuus ja emäksisyys ovat tärkeimmät syyt Oceanospirillales-kasvien rikastumiseen suola-alkalimaaperässä. Tämä tulos viittaa vahvasti siihen, että suurin 2'-asetyylilakteosidin pitoisuus suolaliuoksessa-alkalissa liittyy Oceanospirillales-kasvien rikastumiseen. Oceanospirillalesin ja 2′-asetyylilakteosidin välinen sääntelysuhde on kuitenkin edelleen tyhjä, ja lisätutkimusta tarvitaan.
Seitsemän PhG:n kokonaispitoisuudet ovat korkeimmat laidunmailla, joista ekinakosidi on hallitseva PhG. Ekinakosidi korreloi merkittävästi positiivisesti Sphingomonadalesin kanssa, joka on alfa-proteuksen sekvenssi ja muodostaa Erythrobacteraceae- ja Sphingomonadaceae-heimon. Molemmat perheet ovat yleisiä luonnossa, erityisesti maaperässä, valtamerissä ja makeassa vedessä36. Sphingomonadalesilla on laaja valikoima aromaattisten yhdisteiden metabolista kapasiteettia, ja jotkut kannat voivat syntetisoida arvokkaita solunulkoisia biopolymeerejä37. Kaikki aiemmin tunnetut Sphingomonas-luokan jäsenet ovat aerobisia ja kemiallisesti orgaanisia. Ainoa poikkeus on fakultatiivinen anaerobinen etanolifermentori, jota käytetään fermentoidun juomasellun valmistukseen. Tietyillä Rhodobacter-, porfyriini- ja Staphylococcus aureus-suvun lajeilla sekä tietyillä Sphingomonas-suvun lajeilla on klorofylli a ja siksi ne ovat valinnaisia fotoorganotrofeja (fotosynteesin kautta muodostuvaa energiaa)38. C. deserticolan paras laatu niityllä saattaa johtua mikrobiyhteisön rikkaasta monimuotoisuudesta ja biomarkkerin (Sphingomonadales) aineenvaihduntaan liittyvistä toiminnoista. Tämä havainto tarjoaa uuden käsityksen tutkimuksesta C. deserticolan laatuvaihteluista eri ekotyypeissä.
Kolmen C. deserticola -ekotyypin maaperän mikrobiomien aineenvaihduntatoimintoprofiilien ennuste.C. deserticolan maaperän mikrobiomien metaboliset toimintaprofiilit (kuva 6 ja tiedosto S1) näissä kolmessa ekotyypissä osoitettiin ensimmäistä kertaa tässä tutkimuksessa. Aineenvaihdunnan kannalta hiilihydraattiaineenvaihdunta (tärkkelys- ja sakkaroosiaineenvaihdunta, ko00500; aminosokeri- ja nukleotidisokeriaineenvaihdunta, ko00520) ja aminohappoaineenvaihdunta (arginiini- ja proliiniaineenvaihdunta, ko00330; glysiinin, seriinin ja treoniinin aineenvaihdunta, ko00260) ovat erittäin rikastettuja mikrobiomit. Hiilihydraattiaineenvaihdunta on vastuussa hiilihydraattien muodostumisesta, hajoamisesta ja muuntamisesta kehossa. Hiilihydraatit ovat monien tärkeiden aineenvaihduntareittien perusta39. Hiilihydraatit, kuten glukoosi, ovat osa erilaisia aineenvaihduntareittejä lajien välillä. Kasvit syntetisoivat hiilihydraatteja ilmakehästä fotosynteesin kautta, ja niitä voidaan käyttää substraattina soluhengitykseen40. Kasvit ja mikro-organismit imevät ammoniakkia, ammoniumsuolaa, nitriittiä, nitraattia ja muuta epäorgaanista typpeä ympäristöstä syntetisoidakseen proteiineja ja typpeä sisältäviä aineita. Jotkut mikrobit voivat muuntaa N2:ta ilmasta ammoniakkitypeksi aminohappojen syntetisoimiseksi41. Maaperän mikrobiomien metabolinen toiminta rikastui primaarisessa aineenvaihdunnassa. Tämä rikastuminen viittaa siihen, että mikrobiomit voivat tarjota ravintoa kasveille ja edistää niiden kasvua kuivuuden ja muiden stressien alla.
Aineenvaihduntatoimintoprofiilit osoittivat myös, että ympäristötiedon käsittelyssä kalvokuljetukset (ABC-kuljettajat, ko02010) ja signaalinsiirto (kaksikomponenttijärjestelmä, ko02020) ovat erittäin rikastuneita mikrobiomeilla. Kalvokuljetus on kokoelma mekanismeja, jotka säätelevät liuenneiden aineiden, kuten ionien ja pienten molekyylien, kulkemista biokalvon läpi, joka on proteiineihin upotettu lipidien kaksoiskerros. Ristikkäisten kalvojen säätely johtuu selektiivisten kalvojen läpäisevyydestä, joka on biofilmien ominaisuus, joka mahdollistaa erilaisten kemiallisten ominaisuuksien omaavien aineiden erottamisen. Toisin sanoen nämä kalvot saattavat olla läpäiseviä joillekin aineille, mutta eivät muille42. Näiden kalvojen joukossa ABC-kuljetusreitti oli erittäin rikastunut maaperän mikrobiomeilla. ATP-sidoslaatikon (ABC) kuljettajia on yleisesti mikro-organismeissa, kuten bakteereissa, ja ne ovat yksi suurimmista nykyään tunnetuista proteiiniperheistä. Nämä kuljettajat sitoutuvat ATP:n hydrolyysiin osallistuakseen monimuotoisten substraattien, kuten ionien, peptidien, lipidien, lääkkeiden, sokereiden, proteiinien ja sterolien, aktiiviseen kuljetukseen. Prokaryoottien ABC-kuljettajien rakenne koostuu yleensä kolmesta osasta. Yleensä kahdessa ehjässä kalvoproteiinissa on kummassakin kuusi transmembraanista fragmenttia: kaksi perifeeristä proteiinia, jotka sitovat ja hydrolysoivat ATP:tä, ja yksi perifeerinen (tai lipoproteiini) sitoutuvan proteiinin substraatti. Kuten monien bakteerien ja arkkien genomeissa havaitaan, monet näiden kolmen komponentin geenit muodostavat operoneja43. Kuivuus, suolaisuus ja alkalistressi edistivät kalvon kuljetustoimintoa, erityisesti maaperän mikrobiomien aktiivisen kuljetustoiminnan parantamista.
Signaalinsiirto on prosessi, jossa kemiallinen tai fyysinen signaali välitetään solun läpi sarjana molekyylitapahtumia. Yleisin on proteiinikinaasin katalysoima proteiinin fosforylaatio. Kaksikomponenttinen järjestelmä on signalointireitti, joka säätelee monia bakteerien ominaisuuksia, kuten toksisuutta, patogeenisyyttä, symbioosia, liikkuvuutta, ravinteiden imeytymistä, sekundaaristen metaboliittien tuotantoa, aineenvaihdunnan säätelyä ja solujen jakautumista. Nämä järjestelmät säätelevät fysiologisia prosesseja ympäristö- tai soluparametrien perusteella, mikä mahdollistaa niiden sopeutumisen muuttuviin olosuhteisiin44. Maaperän mikrobiomien signaalinsiirtoa edisti kuivuus tai suola-alkalistressi.
CistancheOte CanAntioksidantti
johtopäätös
Tämä tutkimus on ensimmäinen, joka esittelee C. deserticolan kolmen ekotyypin maaperän mikrobiomit. Tehdään seuraavat johtopäätökset: (1) Maaperän mikrobiyhteisö niityillä on runsain kolmesta elinympäristöstä. (2) Kolmen ekotyypin biomarkkerit määritettiin myös: Oceanospirillales (suola-alkalimaa), Sphingomonadales (nurmimaa) ja Propionibacteriales (hiekkamaa). (3) Ydinmikrobiomianalyysi osoitti, että C. deserticolan maaperän mikrobiyhteisöillä oli enimmäkseen kuivuutta, suolansietokykyä, alkalikestävyyttä ja stressiresistenssiä, kuten Micrococcales ja Bacillales. (4) Korrelaatioanalyysi osoitti, että 2'-asetyylilakteosidi korreloi positiivisesti Oceanospirillalesin kanssa ja ekinakosidi korreloi merkittävästi positiivisesti Sphingomonadalesin kanssa. (5) Tax4Fun ennustaa, että kolmen maaperän mikrobiomin ekotyypin aineenvaihduntatoimintoprofiilit rikastuvat aineenvaihdunnassa ja ympäristötietojen käsittelyssä.
Viitteet
1. Zheng, S., Jiang, X., Wu, L., Wang, Z. & Huang, L. Cistanches herban kemiallinen ja geneettinen erottelu UPLC-QTOF/MS- ja DNA-viivakoodauksen perusteella. Plus One 9, e98061 (2014).
2. Li, Z. et ai. Cistanche deserticola YC Ma:n ekologinen mallinnus Alxassa, Kiinassa. Tieteelliset raportit 9, 13134, https://doi.org/10.1038/s41598-019-48397-6 (2019).
3. Joseph, E. et ai. Riisin juureen liittyvien mikrobiomien rakenne, variaatiot ja kokoonpano. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America 112, E911 (2015).
4. Jansson, JK & Hofmockel, KS Maaperän mikrobiomi ja ilmastonmuutos. Luontoarvostelut. Microbiology, https://doi.org/10.1038/s41579-019-0265-7 (2019).
5. Wang, X. et ai. Viljellyn Cistanche deserticolan eri osien kemiallisten profiilien ja antioksidanttiaktiivisuuden vertailu Ultra Performance -nestekromatografia-kvadrupolien lentoaikamassaspektrometrialla ja 1,1-difenyyli-2--pikryylihydratsyylipohjaisella analyysillä. Molecules 22, 2011 (2017).
6. Yang, L. et ai. Cistanche deserticolasta eristetyn fenyylietanoidiglykosidin kokonaisfraktion hyödylliset vaikutukset luun mikrorakenteeseen rotilla, joilta on poistettu munasarjat. Oksidatiivinen lääketiede ja solujen pitkäikäisyys 2019, 2370862, https://doi. org/10.1155/2019/2370862 (2019).
7. Liu, W. et ai. (1)H NMR-pohjaisesta kohdentamattomasta LC-MS-pohjaiseen kohdennettuun metabolomiikkastrategiaan perusteellisiin kamomillavertailuihin neljän Cistanche-lajin välillä. Journal of Farmaseuttinen ja biolääketieteen analyysi 162, 16–27, https://doi.org/10.1016/j. jpba.2018.09.013 (2019).
8. Chen, H. et ai. Lääkekasvin ydinmikrobiomi Salvia miltiorrhiza -siemen: rikas hyödyllisten mikrobien säiliö sekundaarista aineenvaihduntaa varten? International Journal of Molecular Sciences 19, 672 (2018).
9. Sonnenburg, JL & Backhed, F. Ruokavalion ja mikrobiston vuorovaikutukset ihmisen aineenvaihdunnan hidastajina. Nature 535, 56–64, https://doi. org/10.1038/nature18846 (2016).
10. Ju, F. & Zhang, T. 16S rRNA-geenin korkean suorituskyvyn sekvensointitiedon louhinta mikrobien monimuotoisuudesta ja vuorovaikutuksista. Applied Microbiology and Biotechnology 99, 4119–4129 (2015).
11. Cui, J.-L., Vijayakumar, V. & Zhang, G. Sienien endofyyttiryhmittymien osiointi juuriloiskasvissa Cynomorium songaricum ja sen isäntä Nitraria tangutorum. Frontiers in Microbiology 9, 666 (2018).
12. Fan, P., Liu, P., Song, P., Chen, X. & Ma, X. Kohtuullinen ruokavalion proteiinirajoitus muuttaa suoliston mikrobiotan koostumusta ja parantaa ileaalisen esteen toimintaa aikuisten sikojen mallissa. Tieteelliset raportit 7, 43412 (2017).
13. Munyaka, PM et ai. Mo1774 Prenataalinen antibioottihoito lisää jälkeläisten alttiutta kokeelliselle paksusuolitulehdukselle: suoliston mikrobiotan rooli. Plus One 10, e0142536 (2015).
14. Zhao, Y. et ai. Sekoitusintensiteetin vaikutus yhden pystysuoran reaktorin suorituskykyyn ja mikrobidynamiikkaan integroi asidogeeniset ja metanogeeniset faasit lignoselluloosabiomassan mädätyksessä. Bioresource technology 238, 542–551 (2017).
15. Cole, JR et ai. Ribosomal Database Project: parannetut kohdistukset ja uudet työkalut rRNA-analyysiin. (2009).
16. Edgar, RC UPARSE: erittäin tarkat OTU-sekvenssit mikrobiamplikonilukemista. Nature Methods 10, 996 (2013).
17. Yu, W. et ai. Makean veden, vuorovesikosteikkojen ja meren sedimenttien bakteerien monimuotoisuuden tasojen vertailu käyttämällä miljoonia Illumina-tunnisteita. Applied & Environmental Microbiology 78, 8264 (2012).
18. Jiang, XT et ai. 16S-rRNA-tunnisteen Illumina-sekvensointi paljasti bakteeriyhteisöjen spatiaalisia variaatioita mangrovekosteikolla. Microbial Ecology 66, 96–104 (2013).
19. Sanner, MF Python: ohjelmointikieli ohjelmistojen integrointiin ja kehittämiseen. Journal of Molecular Graphics & Modeling
17, 57–61 (1999).
20. Caporaso, JG et ai. QIIME mahdollistaa korkean suorituskyvyn yhteisön sekvensointitietojen analysoinnin. Nat Methods 7, 335-336, https://doi. org/10.1038/nmeth.f.303 (2010).
21. Chong, J., Liu, P., Zhou, G. & Xia, J. MicrobiomeAnalyst käyttäminen mikrobiomitietojen kattavaan tilastolliseen, toiminnalliseen ja meta-analyysiin. Nature Protocols, 1–23 (2020).
22. Dhariwal, A. et ai. MicrobiomeAnalyst: verkkopohjainen työkalu mikrobiomitietojen kattavaan tilastolliseen, visuaaliseen ja meta-analyysiin. Nucleic acids research 45, W180–W188 (2017).
23. Šmilauer, P. & Lepš, J. Ekologisen tiedon monimuuttujaanalyysi CANOCO 5:llä. (Cambridge University Press (2014).
24. Shannon, P. et ai. Cytoscape: ohjelmistoympäristö biomolekyylien vuorovaikutusverkostojen integroiduille malleille. Genome Research 13, 2498–2504 (2003).
25. Asshauer, KP, Wemheuer, B., Daniel, R. & Meinicke, P. Tax4Fun: funktionaalisten profiilien ennustaminen metagenomisen 16S rRNA:n tiedoista. Bioinformatics (Oxford, Englanti) 31, 2882–2884, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv287 (2015).
26. Koo, H. et ai. Kahden bioinformatiikan työkalun vertailu, joita käytetään karakterisoimaan mikrobien monimuotoisuutta ja ennakoivia toiminnallisia ominaisuuksia Obersee-järvestä Etelämantereelta. Journal of Microbiological methods 140, 15–22 (2017).
27. Huang, L., Zheng, S., Wu, L., Jiang, X. & Chen, S. Cistanche deserticolan ekotyypit kemiallisen koostumuksen ja molekyyliominaisuuksien perusteella. Scientia Sinica Vitae 44, 318–328 (2014).
28. Gabriele, B. & Kornelia, S. Kasvilajit ja maaperän tyyppi muokkaavat yhdessä mikrobiyhteisöjen rakennetta ja toimintaa risosfäärissä. Fems Microbiology Ecology 68, 1–13 (2010).
29. Parte, AC LPSN – prokaryoottisten nimien luettelo nimikkeistössä. Nucleic acids research 42, 613–616 (2014).
30. Pirog, T., Grinberg, T. & Malashenko, YR Acinetobacter sp.:n tuottamien eksopolysakkaridien suojaavat toiminnot. Microbiology (New York, NY) 66, 279-283 (1997).
31. Liu, Y.-H. et ai. Halofyyttiin Lycium ruthenicum Murr liittyvien endofyyttien monimuotoisuus, yhteisöjakauma ja kasvua edistävät toimet. 3 Biotech 9, 144 (2019).
32. Staley, Bryant, Pfennig, Holt & JG Bergeyn systemaattisen bakteriologian käsikirja - osa 4. Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 38, 89–100 (1989).
33. Pasqua, RD et ai. Eri lignoselluloosalähteiden vaikutus Bacillus amyloliquefaciens B31C:n endo-1,4- -glukanaasigeenin ilmentymiseen ja entsymaattiseen aktiivisuuteen. Bioresources 9 (2014).
34. Pot, B. & Gillis, M. Oceanospirillum. (2015).
35. Euzeby, JP Lista bakteerien nimistä, joissa on nimikkeistö: kansio, joka on saatavilla Internetissä. International Journal of systematic bacteriology 47, 590–592, https://doi.org/10.1099/00207713-47-2-590 (1997).
36. Balkwill, DL, Fredrickson, JK & Romine, MF Sphingomonas ja muut sukulaiset. Prokaryotes 7, 605-629 (2003).
37. Takeuchi, M., Hamana, K. & Hiraishi, A. Ehdotus suvusta Sphingomonas sensu stricto ja kolmesta uudesta suvusta, Sphingobium, Novosphingobium ja Sphingopyxis, fylogeneettisten ja kemotaksonomisten analyysien perusteella. International Journal of Systematic & Evolutionary Microbiology 51, 1405–1417 (2001).
38. Saori, S. & Akira, H. Novosphingobium naphthalenivorans sp. marraskuuta, naftaleenia hajottava bakteeri, joka on eristetty polyklooratun dioksiinin saastuttamasta ympäristöstä. Journal of General & Applied Microbiology 53, 221–228 (2007).
39. Alánt, O., Pulay, I., Esztergályos, J. & Bodnár, A. Leikkauksen vaikutus hiilihydraattiaineenvaihduntaan. Acta Chirurgica Academiae Scientiarum Hungaricae 16, 307 (1975).
40. Harmaa, GM Hiilihydraattien sulaminen ja imeytyminen. Encyclopedia of Gastroenterology 58, 275–278 (2004).
41. Coon, MJ & Robinson, WG Amino AcidMetabolism. (2003).
42. Purves, WK, Orians, G., Heller, C. & Sadava, D. Vida, LaCiencia de la Biología. 8ª painos. Panamericana (2009).
43. Schneider, E. & Hunke, S. ATP-sidoskasetti (ABC) -kuljetusjärjestelmät: ATP:tä hydrolysoivien alayksiköiden/verkkotunnusten toiminnalliset ja rakenteelliset näkökohdat. Fems Microbiology Reviews 22, 1-20 (1998).
44. Kleerebezem, M., Quadri, LE, Kuipers, OP & Vos, WM De. Peptidiferomonien ja kaksikomponenttisten signaalinvälitysjärjestelmien avulla tapahtuva koorumin havaitseminen grampositiivisissa bakteereissa. Molecular Microbiology 24, 895–904 (2010).
