Uusi vuosi, uusi SARS-CoV-2 Variantti: Omicronin kohdattava genomivalvontaprotokollat

Ottaa yhteyttä:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

SARS-CoV-2-muunnelmien ilmaantuminen, joilla on parannettu siirrettävyys ja osittainenimmuunipako (tunnetaan myös nimellä Variants of Concern, VOC) on leimannut COVID{0}}-pandemian toista vuotta. Genomivalvonnan avulla voidaan tunnistaa piilotetut, nopeasti leviävät sukulinjat ja VOC-yhdisteet ennen kuin niistä tulee kansanterveysuhka. Chilen kansanterveysinstituutti (Instituto de Salud Publica, ISP) on johtanut SARS-CoV{3}} -genomivalvontaaloitteita Chilessä. Sekvensointitietojen avulla Internet-palveluntarjoaja on ilmoittanut haihtuvien orgaanisten yhdisteiden käyttöönotosta ja karakterisoinut niiden tarttuvuuden ja mutaatioiden allekirjoitukset, mikä auttoi ymmärtämään paremmin pandemian paikallisia piirteitä.1

cistanche propiedades: osittainenimmuunipaeta

17. joulukuuta 2021 mennessä uusi Omicron VOC oli levinnyt nopeasti 89 maahan, mukaan lukien Chileen.2 Joulukuun 21. päivään mennessä Internet-palveluntarjoaja oli tunnistanut 119 näytettä Omicroniksi. Näistä 118 vastaa saapumista SCL-lentoasemalle ja yksi yhteisölähetystä (kuva 1a, b). Vaikka Omicronin epidemiologisia piirteitä tutkitaan edelleen, nykyiset raportit viittaavat kahteen huolestuttavaan tosiasiaan: Ensinnäkin Omicronilla on laaja paeta sekä luonnolliselta että rokotteen aiheuttamalta neutraloinnilta, mikä lisää uudelleentartunnan ja läpimurtoinfektioiden mahdollisuuksia.

cistanche-salsan edut

Erityisesti,Omicronin immuunipakeneminen vähentäisi rokotteen tehokkuutta oireellisia sairauksia vastaan ​​35 prosenttiin ja 73 prosenttiin 2x vastarokotetuilla henkilöillä, kun otetaan huomioon mRNA-rokotteet (Pfifizer-BioNTechin BNT162b2).3 Lisäksi tämä suoja infektiota vastaan ​​näyttää heikkenevän muutamassa kuukaudessa ja Pakenemisprosentti on paljon korkeampi heterologisella BNT162b2-tehosterokotteella yksilöillä, jotka on rokotettu täysin Sinovacin inaktivoidulla virusrokotteella CoronaVac.4,5 Vaikka 9. tammikuuta 2022 mennessä 86,6 prosenttia Chilen väestöstä on täysin rokotettuja ja 60,5 prosenttia prosentti on saanut tehosterokotteen6 (kuva 1c), suurin osa annetuista annoksista vastaa CoronaVac-annoksia (55,3 prosenttia), jota seuraa BNT162b2 (36,4 prosenttia, tyypillisesti tehoste),7 mikä vaarantaa uuden aallon.4

antosyaanilisäaineet ja cistanche-lisäaineet

Toiseksi, aluksi ja uusien NPI:iden puuttuessa Omicron saavutti 1.5- 3 päivän kaksinkertaistumisajan8, mikä levisi nopeammin kuin Delta VOC. Kuitenkin tämä selittyy paremmin Omicronin laajallaimmuunipakoon sen sijaan, että se lisäisi perustransfersibiliteettiä.9 Siksi tiukemmat NPI:t voivat vähentää lähetystä huomattavasti. Vaikka Omicron-tartunnalle näyttäisikin säilyvän suoja vakavaa kulkua vastaan, korkea väestön ilmaantuvuus vaarantaa kriittisen infrastruktuurin oikean toiminnan, sillä suuri osa työvoimasta vaatisi testejä ja karanteenia. Siksi tietoisen päätöksenteon kannalta on olennaista määrittää kiertävät variantit ja ominaisuudet genomivalvonnan avulla.

Vaikka genominen valvonta tarjoaa tilannekuvan kiertävistä varianteista ja niiden mutaatioiden allekirjoituksista, sen luotettavuus riippuu näytteenottoprotokollan laadusta. Seuraavassa tiivistetään viralliset genomivalvontaa koskevat suositukset10 neljään yksinkertaiseen sääntöön, jotka on otettava huomioon SARS-CoV{2}} -genomivalvonnan vankan näytteenottoprotokollan kannalta: CARD-säännöt:

1. Koordinoitu: Eri yksiköiden ponnistelut tulisi suunnata ja yhdenmukaistaa keskitetysti, jotta vältetään valintaharha, varmistetaan edustavuus, optimoidaan resurssien allokointi ja standardoidaan näytteenottoprotokollat. Tämän kokonaisuuden tulisi myös varmistaa näytteenottoprotokollan läpinäkyvyys, joka tulee raportoida genomitietojen kanssa GISAIDille.

2. Adaptiivinen: Sekvensoinnin intensiteettiä tulisi lisätä paremman resoluution saamiseksi, kun uusi variantti signaloidaan POE:issä ja havaitaan yhteisön lähetyksessä, ja laskea sen perusarvoon, kun muunnelman dominanssi todetaan. Näin toimimalla päättäjät voivat toimia ennaltaehkäisevästi (vrt. kuva 1d).

3. Edustava: Näytteenottoprotokollan tulee ottaa huomioon alueelliset heterogeenisyydet, kohdistaa eri etnografisiin ryhmiin, ottaa huomioon mahdolliset törmäysharhat (esim. näytteenotto vain oireettomista tai rokottamattomista yksilöistä tai samasta tartuntaketjusta) ja olla verrannollisia nykyiseen esiintyvyyteen. säilyttää edustavuuden. Chilen kaltaisissa maissa, joissa kaupunkikeskukset ovat hajallaan, edustavuus on varmistettava alueellisesti.

4. Erotus: Näytteitä, jotka on kerätty (i) tulopisteistä (POE) ja (ii) valvontakeskuksista, tulisi käsitellä ja analysoida erikseen, koska ne palvelevat eri tarkoituksia. Kun uusia uhkia havaitaan POE:ssä, yhteisön otantaa tulee lisätä, jotta varhainen korvausdynamiikka varianttien välillä saadaan tarkasti talteen.

Koska olemme jo havainneet Omicronin yhteisön leviämisessä, Chilen poliittisten päättäjien tulisi dynaamisesti mukauttaa ei-lääketieteellisten toimenpiteiden ankaruutta estääkseen sen leviämisen samalla kun tarjotaan tehoste-mRNA-rokotteita suuremmille osille väestöstä.11 Tässä vaiheessa genomivalvonta on elintärkeää valmiudelle ja päätöksentekijöille. ei pitäisi vain pyrkiä surffaamaan aallolla, vaan myös oppia siitä. Kaiken kaikkiaan meillä on suuremmat mahdollisuudet menestyä, jos pelaamme KORTTIT oikein.

parantaa immuniteettiarohdosvalmisteet

Viitteet

1 Tai ostica KY, Contreras S, Mohr SB, et ai. SARS-CoV-2 Gamma- ja Lambda-muunnelmien mutaatioiden allekirjoitukset ja siirrettävyys. arXiv preprint arXiv:2108.10018. 2021.

2 Viana R, Moyo S, Amoako DG, et ai. SARS-CoV-2 Omicron-variantin nopea epidemialaajeneminen Etelä-Afrikassa. Luonto. 2022.

3 Cele S, Jackson L, Khoury DS, et ai. Omicron välttää laajasti mutta epätäydellisesti Pfifizer BNT162b2 -neutraloinnin. Luonto. 2021.

4 Perez-Then E, Lucas C, Monteiro VS, et ai. Heterologisen BNT162b2-tehosterokotteen immunogeenisyys CoronaVacilla täysin rokotetuilla yksilöillä SARS-CoV-2-variantteja Delta ja Omicron vastaan: Dominikaanisen tasavallan kokemus. medRxiv. 2021.

5 Lu L, Mok BW, Chen L, et ai. SARS-CoV-2 Omicron-variantin neutralointi BNT162b2- tai Coronavac-rokotteen saajien seerumilla. Clin Infect Dis. 2021:ciab1041.

6 Mathieu E, Ritchie H, Ortiz-Ospina E, et ai. Maailmanlaajuinen tietokanta COVID-19-rokotuksista. Nat Hum Behav. 2021:1–7.

7 168 aste informe epidemiologico, informe incidencia y gravedad de Casos covid-19 secun antecedentes de Vacunacion e informe Estra tegia Nacional de Tta [Internet]. Departamento de Estadisticas e Informacion de Salud. [lainattu 2022 tammikuu 13].

8 Torjesen I. Covid-rajoitukset kiristyvät, koska Omicron-tapaukset kaksinkertaistuvat kahden tai kolmen päivän välein. BMJ. 2021;375:n3051

9 Lyngse FP, Mortensen LH, Denwood MJ, et ai. SARS-CoV-2 Omi cron VOC-lähetys tanskalaisissa kotitalouksissa. medRxiv. 2021 joulukuuta

10 Maailman terveysjärjestö. Ohjeita SARS CoV-2 -muunnelmien valvontaan. Väliaikainen ohje. [Internet] 9. elokuuta 2021.

11 Bauer S, Contreras S, Dehning J, et ai. Rokotusvauhtia koskevien rajoitusten lieventäminen lisää vapautta ja suojaa uusilta COVID-19-aaltoilta. PLoS Comput Biol. 2021;17:(9) e1009288