Cistanchen kokonaisglykosidien vaikutusmekanismin tutkiminen tulehduksellisissa suolistosairaudissa verkkofarmakologian ja eläinkokeiden perusteella Ⅲ

3 Tulokset ja analyysit

3.1 Cistanche tubulosan kokonaisglykosidien kohteiden ja sairauskohteiden analyysi

Tuo kolmiulotteiset rakennetiedostotaktiiviset ainesosatPharmMapper-tietokantaan saadaksesi eri ainesosia vastaavat kohdepisteet. UniProt-tietokantaa käytettiin kutakin kohdetta vastaavan proteiinin nimen ja geenin nimitietojen saamiseksi. Yhdistämällä seitsemää komponenttia vastaavat kohdepisteet saatiin yhteensä 354 tavoitetta. GeneCards-tietokannasta haettiin relevantteja geenejä avainsanalla "tulehduksellinen suolistosairaus" ja hakutuloksia lajiteltiin ja lopulta saatiin 7851 kohdetta. Piirrä Venn-kaavio verkossa tapahtumien avulla saadaksesi Cistanche tubulosan vaikuttavan aineen kohteiden ja IBD:n kohdepisteiden leikkauspisteet. Kuten kuvassa 1 näkyy, 254 kohteen vaikuttavan aineenCistanche tubulosajoilla on suojaava vaikutus IBD:tä vastaan.

Kuva 2 PPI-verkkokaavio yleisistä kohteista

Kuva 5 Komponentti-kohde-polkuverkko

Kuva 7 Cistanche tubulosan kokonaisglykosidit heikentävät TGF- ja mTOR-signalointireittien mRNA:ta IBD-hiirissä

3.4 Cistanche tubulosa -glykosidit parantavat DSS:n aiheuttamaa DAI-pistemäärää

Testitulokset osoittivat, että CZ-ryhmää lukuun ottamatta kolmessa muussa ryhmässä painonpudotus ja piilevä verta ulosteessa oli vaihtelevaa (kuva 6). Heistä DSS-vertailuryhmällä oli korkein ruumiinpainon lasku, vakavin ulosteen veri, korkein DAI ja ilmeinen ulosteen verenvuoto kuudentena päivänä. Cistanche tubulosan kokonaisglykosidien puuttumisen jälkeen DAI-pistemäärä väheni vähitellen ja piilevän veren tilanne väheni vähitellen. HZ-ryhmällä oli alhaisin painonpudotus ja pienin määrä piiloverta ulosteessa. Tulokset osoittivat, että Cistanche tubulosan kokonaisglykosidit paransivat tulehduksellisen suolistosairauden aiheuttamia fysiologisia vasteita.

CISTANCH-LISÄ IBD-HOIDON PHGS75% ECH 30% ACT 12%

3.5 Cistanche tubulosa kokonaisglykosidit vähentävät IBD:tä

mTOR- ja TGF-signalointireittien ilmentyminen hiiren pernassa mTOR- ja TGF-signalointireitit ovat kaksi tärkeää signalointireittiä, jotka aktivoivat tulehdusvasteita. mTOR:n ja TGF-:n ilmentyminen hiirten pernakudoksessa havaittiin qRT-PCR:llä. Tulokset osoittivat, että mTOR:n ja TGF-:n mRNA-ilmentyminen DSS-kontrolliryhmän hiirillä oli merkittävästi lisääntynyt verrattuna normaaleihin hiiriin. Verrattuna DSS-kontrollihiiriin, Cistanche tubulosaan verrattuna mTOR- ja TGF-ilmentyminen hiirissä väheni merkittävästi Cistanche tubulosa -intervention jälkeen. Heistä suuria annoksia saaneiden ryhmässä oli merkittävin lasku, ja ilmentymistaso oli periaatteessa yhdenmukainen normaalin ryhmän kanssa (kuvio 7). Tulokset osoittivat, että Cistanche tubulosan kokonaisglykosidit säätelevät alas mTOR- ja TGF-signalointireittien ilmentymistä.

Kuva 8 PICRUSt2-toiminnallisen runsausklusteroinnin lämpökartta

3.6 PICRUSt2:n toiminnallinen annotaatioanalyysi

PICRUSt2 on bioinformatiikkatyökalu metagenomisen toiminnan ennustamiseen Greengene-tietokannan biologisen 16S-rRNA:n, ASV-puun ja ASV-geenitietojen perusteella. Toiminnan ennustamiseen käytettiin valikoitua COG-tietokantaa, ja tulokset osoittivat, että suolistoflooran toimintoihin liittyy pääasiassa RNA:n prosessointia; kromatiinin rakenne ja dynamiikka; solusyklin ohjaus, solujen jakautuminen, kromosomien segmentointi; puolustusmekanismi; signalointi soluseinän/solukalvon/vaipan biogeneesistä; solut Sillä on yli 20 tehtävää, kuten solunulkoinen rakenne; solunsisäinen kuljetus, eritys ja vesikkelikuljetus; energian tuotanto ja muuntaminen; hiilihydraattien kuljetus ja aineenvaihdunta. Valitse kustakin näytteestä 15 yleisintä ominaisuutta ja niiden runsaustiedotTiedoille piirretään lämpökartta (kuva 8), joka klusteroidaan eri toimintatasoilta.

Verrattuna CZ-ryhmään DZ-kontrolliryhmän hiirillä oli COG1132 (ABC-tyyppinen usean lääkkeen kuljetusjärjestelmä), COG0745 (DNA:ta sitovan vasteen säätelijä), COG1131 (ABC-tyypin monen lääkkeen kuljetusjärjestelmä), COG1961 (paikkaspesifinen DNA-rekombinaasi, joka liittyy DNA-invertaasi Pin), COG0438 (glykosyylitransferaasi mukana).soluseinän biosynteesissä), COG0534 (Na +-ohjattumonen lääkkeen ulosvirtauspumppu), COG0642 (Signaalitransduktion histidiinikinaasi), COG1595 (DNA-ohjattu RNA-polymeraasin erikoistunut sigma-alayksikkö), COG0463 (endonukleaasi), COG4974 (paikkaspesifinen rekombinaasi XerD), COG22207-DNA-sidosdomeeni ja A-tyypin DNA-raja sisältäviä proteiineja), COG1136 (ABC-tyyppinen lipoproteiinien vientijärjestelmä).) ja COG1309:n (DNA:ta sitova transkription säätelijä) toiminnalliset geeniekspression poikkeavuudet. Nämä geenit ovat pääasiassa mukana: V: puolustusmekanismi; T: signaalinsiirtomekanismi; M: soluseinän/solukalvon/vaipan biogeneesi; I: lipidien kuljetus ja aineenvaihdunta; K: transkriptio; L: replikointi, rekombinaatio ja korjaus.

Sen jälkeen kun näille kuudelle funktiolle annettiin Cistanche tubulosan kokonaisglykosideja, näiden erilaisten fysiologisten toimintojen ilmentyminen oli lähellä normaalin ryhmän ekspressiota. Verrattuna hiiriin CZ- ja DZ-ryhmissä, HZ-ryhmän hiirillä oli korkea COG1028- (lyhytketjuinen alkoholidehydrogenaasiperhe)- ja COG0451-geenien (nukleosidi-fosfaatti-sokeriepimeraasi) ekspressio. Nämä kaksi geeniä liittyvät I:hen: lipidien kuljetus ja aineenvaihdunta. Ja M: Soluseinän/solukalvon/vaipan biogeneesitoiminnot liittyvät läheisesti toisiinsa. Siksi oletetaan, että Cistanche tubulosan kokonaisglykosidit voivat säädellä IBD-hiirten vaurioita säätelemällä lipidiaineenvaihduntaa, glukoosiaineenvaihduntaa ja vastaavia puolustussignaalin välitysmekanismeja hiirissä.